临床上常用的方法有：1、雌孕激素替代治疗。2、预防骨质疏松。3、促排卵治疗。4、免疫治疗：免疫因素是卵巢早衰的一个病因。5、DHEA治疗：DHEA的含量高低对激素水平有影响。6、赠卵胚胎移植术。7、卵巢移植。

干细胞治疗是近些年新兴的卵巢早衰治疗手段，干细胞具有“归巢”属性，通过将高数量和质量的干细胞直接移植到患者卵巢，利用干细胞的自我复制和分化潜能来修复受损的细胞，恢复受损器官、组织的正常功能。病理组织切片上可以观察到，卵巢各级卵泡数在明显增加，颗粒细胞生长，抗颗粒细胞凋亡，内分泌功能明显得到改善，甚至恢复受孕等。