染色体异常：是卵巢早衰最主要的原因之一，常见的是X染色体异常，比如特纳综合征。还与某些特定的遗传性疾病有关，比如脆性x综合征。

环境因素：长期在有毒的环境中工作，比如杀虫剂或是烟草烟雾等的不良环境。

病毒感染：比如腮腺炎等的病毒可能会损伤卵巢组织，导致卵巢早衰。

免疫因素：自身免疫性疾病如类风湿、系统性红斑狼疮等。

医源性因素：比如手术对卵巢的损伤，放化疗药物对卵巢的损伤等。

干细胞具有“归巢”属性，通过将高数量和质量的干细胞直接移植到患者卵巢，利用干细胞的自我复制和分化潜能来修复受损的细胞，恢复受损器官、组织的正常功能。病理组织切片上可以观察到，卵巢各级卵泡数在明显增加，颗粒细胞生长，抗颗粒细胞凋亡，内分泌功能明显得到改善，甚至恢复受孕等。