染色体异常：是卵巢早衰最主要的原因之一，常见的是X染色体异常，比如特纳综合征。还与某些特定的遗传性疾病有关，比如脆性x综合征。

环境因素：长期在有毒的环境中工作，比如杀虫剂或是烟草烟雾等的不良环境。

病毒感染：比如腮腺炎等的病毒可能会损伤卵巢组织，导致卵巢早衰。

免疫因素：自身免疫性疾病如类风湿、系统性红斑狼疮等。

医源性因素：比如手术对卵巢的损伤，放化疗药物对卵巢的损伤等。

干细胞可以生成新细胞，为卵巢功能早衰提供再生治疗方法。干细胞微注射活化是通过体外培养具有血管再生、活性组织修复的脐带间充质干细胞，采用微注射种植技术，将活性细胞靶向种植在女性卵巢上。干细胞会达到受损组织和器官，滋养和修复病变卵巢细胞，恢复雌激素分泌水平，以达到修复的目的。