卵巢早衰还可以治疗，如果发生了卵巢早衰的情况，是缺乏雌激素的原因，通常可以适当的补充雌激素，有助于缓解绝经后妇女的症状，而在早期的时候应用雌激素，能够预防绝经后骨质疏松和心血管疾病，甚至能够帮助预防老年痴呆的情况，而常见的药物包括苯甲酸雌二醇、戊酸雌二醇等。

干细胞具有“归巢”属性，通过将高数量和质量的干细胞直接移植到患者卵巢，利用干细胞的自我复制和分化潜能来修复受损的细胞，恢复受损器官、组织的正常功能。病理组织切片上可以观察到，卵巢各级卵泡数在明显增加，颗粒细胞生长，抗颗粒细胞凋亡，内分泌功能明显得到改善，甚至恢复受孕等。