药物治疗卵巢早衰效果比较好，使用药物之前必须做全面的身体检查，根据自身的情况结合医生综合性的评估，可以使用雌激素补充治疗，比较常用的药物有尼尔雌醇和雌二醇凝胶。也可以使用孕激素治疗，比如黄体酮胶囊和地屈孕酮，也可使用雌、孕激素的复方制剂，服用起来比较方便。

干细胞可以生成新细胞，为卵巢功能早衰提供再生治疗方法。干细胞微注射活化是通过体外培养具有血管再生、活性组织修复的脐带间充质干细胞，采用微注射种植技术，将活性细胞靶向种植在女性卵巢上。干细胞会达到受损组织和器官，滋养和修复病变卵巢细胞，恢复雌激素分泌水平，以达到修复的目的。