1、激素替代药物治疗：比较常用的药物，有雌激素、孕激素等等，因这种疾病多半是由于雌激素缺乏而导致的激素替代药物，可以改善由雌激素缺乏而引起的临床症状。同时对于骨质疏松等并发生也有一定的预防效果。

2、植物雌激素的药物治疗：卵巢早衰的患者雌激素较低，而植物雌激素可以改善雌激素低的症状。如果患者对于上述激素替代药物不耐受，可以选择植物雌激素药物治疗。比较常用的药物有杂环多酚类药物等等。

3、辅助生育治疗：如果上述治疗方法无效，且患者有生育需求，则可以选择辅助生育治疗，例如试管婴儿治疗或者胚胎冷冻治疗等等。

干细胞可以生成新细胞，为卵巢功能早衰提供再生治疗方法。干细胞微注射活化是通过体外培养具有血管再生、活性组织修复的脐带间充质干细胞，采用微注射种植技术，将活性细胞靶向种植在女性卵巢上。干细胞会达到受损组织和器官，滋养和修复病变卵巢细胞，恢复雌激素分泌水平，以达到修复的目的。