卵巢衰竭可以恢复，采用雌孕激素替代疗法，能够使年轻女性的卵巢功能加强，改善卵巢功能，常用的雌孕激素有雌二醇等，平时要加强营养，锻炼身体，增加自身的抵抗力，防止骨质疏松症的发生。卵巢衰竭时还可以选择免疫抑制剂来治疗，常用药物有环磷酰胺等。卵巢衰竭也可以采用手术进行治疗，比如卵巢移植。

干细胞治疗是近些年来新兴的治疗手段，为早发性卵巢功能不全患者的生育带来了新的希望。干细胞微注射活化是通过体外培养具有血管再生、活性组织修复的脐带间充质干细胞，采用微注射种植技术，将活性细胞靶向种植在女性卵巢上。干细胞会达到受损组织和器官，滋养和修复病变卵巢细胞，恢复雌激素分泌水平，以达到修复的目的。