治疗卵巢早衰首先要保持健康的饮食以及生活习惯、锻炼、早睡早起是非常重要的。其次是药物治疗，选择雌激素和孕酮替代疗法，由于卵巢衰竭后无排卵，不产生雌性激素或孕酮，可外用口服补充雌激素或孕酮相对都是比较安全的。

干细胞治疗是近些年新兴的卵巢早衰治疗手段，干细胞具有“归巢”属性，通过将高数量和质量的干细胞直接移植到患者卵巢，利用干细胞的自我复制和分化潜能来修复受损的细胞，恢复受损器官、组织的正常功能。病理组织切片上可以观察到，卵巢各级卵泡数在明显增加，颗粒细胞生长，抗颗粒细胞凋亡，内分泌功能明显得到改善，甚至恢复受孕等。