视神经萎缩目前尚无特效疗法能够完全治愈，但可以通过积极的治疗手段来缓解症状、延缓病情进展。视神经萎缩的治疗主要包括药物治疗、手术治疗以及生活方式的调整。药物治疗如使用糖皮质激素、神经营养剂等，可以在一定程度上改善视神经的功能。对于由特定原因(如肿瘤压迫)引起的视神经萎缩，手术治疗可能有效。

干细胞治疗是一种新型治疗方法，干细胞具有诱导分化成视网膜各类细胞的潜能，可能替代已变性的细胞;其分泌的细胞因为周围细胞提供营养，并上调抗凋亡基因，延缓视网膜凋亡。同时干细胞能够保护视网膜血管及促进神经突触行程。移植的干细胞较视网膜组织具有更好的可塑性及移行能力，有助于损伤视网膜的修复。保存或者恢复视力是干细胞治疗期望达到的效果。