严重阴茎短小的主要症状包括：

1.阴茎体积明显小于正常同龄人：患者的阴茎在长度和周长上都会显著小于正常的同龄人。这种差异可以清晰地察觉，并可能对患者的自信和性生活产生负面影响。

2.影响排尿和性功能：除了外观上的短小，患者还可能出现排尿困难、尿量减少等症状。在性功能方面，严重的阴茎短小可能导致勃起功能障碍、早泄等问题，进一步影响患者的性生活质量和性满足度。