预防男性阴茎短小，可以从以下几个方面着手：

生活习惯：改善不良的生活习惯，避免过度手淫，控制刺激性饮料的摄入，如可乐、雪碧等。保持体重在健康范围内，防止肥胖，因为肥胖可能导致脂肪堆积在阴茎周围，使其显得短小。同时，穿宽松舒适、透气性良好的内裤，有助于生殖器官的健康。

饮食调整：多吃富含雄性激素、维生素E和锌的食物，如动物内脏、牛肉、鸡肉、蛋黄、贝类、葡萄、花生、马铃薯、蔬菜等。这些食物有助于为男性生殖器官的发育提供所需的营养。

规律作息与运动：保持规律的作息时间，早睡早起，避免熬夜。加强体育锻炼，如跑步、游泳、打篮球等，有助于增强体质，促进生殖器官的发育。

心理调节：保持乐观向上的积极心态，避免焦虑和压力。同时，与伴侣保持良好的沟通，增进感情，避免性生活过于频繁或禁欲，以保持生殖健康。

治疗相关疾病：对于先天性或后天性疾病，如包皮包茎、睾丸发育不全等，应及时发现并进行治疗，以免影响阴茎的正常发育。