1.体格检查：医生会对患者的生殖器官进行详细的体格检查，观察阴茎的长度、周长、形态等，并评估是否存在其他相关症状或体征。

2.激素水平检测：通过抽血检测血液中的雄性激素水平，如睾酮等，以了解是否存在内分泌异常导致阴茎发育不良的情况。

3.超声检查：在某些情况下，医生可能会建议患者进行超声检查，以进一步了解阴茎内部的血管、组织等结构情况，有助于判断是否存在器质性病变或其他潜在问题。

4.其他相关检查：根据患者的具体情况和医生的判断，还可能需要进行其他相关的检查，如染色体核型分析等，以排除遗传性疾病或其他潜在因素导致的阴茎短小。