治疗卵巢早衰可以采用中医疗法，可辨证性用药，根据病症分别选择用水煎服二仙益冲汤、益肾解郁汤或者四物汤等，同时可给予适当按摩。另外，患者也可采用雌孕激素替代性疗法来治，必要时可配合服用促排卵药品。

干细胞治疗是近些年新兴的卵巢早衰治疗手段，干细胞具有“归巢”属性，通过将高数量和质量的干细胞直接移植到患者卵巢，利用干细胞的自我复制和分化潜能来修复受损的细胞，恢复受损器官、组织的正常功能。病理组织切片上可以观察到，卵巢各级卵泡数在明显增加，颗粒细胞生长，抗颗粒细胞凋亡，内分泌功能明显得到改善，甚至恢复受孕等。