中医认为经水出诸肾，卵巢早衰多归因于肾虚，治疗原则为补肾调经，一般选用周期疗法，即用补肾调周来调月经，促使卵巢功能逐步恢复，从而恢复排卵，恢复正常月经，延缓卵巢的衰老。

干细胞治疗是近些年新兴的治疗手段，干细胞可以生成新细胞，为卵巢功能早衰提供再生治疗方法。干细胞微注射活化是通过体外培养具有血管再生、活性组织修复的脐带间充质干细胞，采用微注射种植技术，将活性细胞靶向种植在女性卵巢上。干细胞会达到受损组织和器官，滋养和修复病变卵巢细胞，恢复雌激素分泌水平，以达到修复的目的。